Ну, это мы специально Вас пугали

Чтобы изначально не было иллюзий, и сразу заряжались на сложную и кропотливую работу.
Конечно же, внедрить зарплату реально, было бы Ваше желание и помощь расчетчиков, а также поддержка руководства. Причем руководство обязательно должно быть в курсе предстоящих сложностей.
Из советов: когда пройдете этап предварительной настройки и ввода исходной информации, нужно обязательно некоторое время (месяца 2-3) вести параллельный расчет. Это поможет донастроить модуль, выявить косяки в расчетах, а главное: обеспечит Вам уверенность в правильности Ваших действий.
И еще. На время параллельного расчета желательно организовать доплату операторам (компенсация двойной нагрузки), это поможет снять часть проблем.
Также очень желательно вести расчет с начала года. Здесь Вам повезло: полтора месяца должно хватить на ввод данных и преднастройку, возможно даже успеете погонять в системе декабрьские данные, с начала года вести параллельный расчет, и где-нибудь с февраля-марта окончательно бросить старую систему.
Желаю успехов!