еще хотелось бы узнать алгоритм инициализации каталогов. как это происходит? от куда система берёт оригинал каталогов? и как можно сделать чтобы при инициализации нужные каталоги(созданные вручную) не удалялись. (может нужные каталоги можно добавить к оригиналу)
Системные каталоги забито жестко в коде.
При Инициализации они либо полностью заменяют существующие, либо добавляются к тому что уже есть.
Режим выбираешь сам в окне инициализации.